Năm 1994, tàu ngầm lớp USS Montana của Hoa Kỳ Ohio đã chạm trán với một vật thể không xác định chìm dưới nước gần máng Cayman. Khi các tàu Liên Xô di chuyển để cố gắng trục vớt tàu ngầm và một cơn bão di chuyển qua khu vực, chính phủ Hoa Kỳ đã gửi một đội SEAL đến Deep Core, một giàn khoan thử nghiệm dưới nước thuộc sở hữu tư nhân gần Cayman Trough để sử dụng làm căn cứ hoạt động. Nhà thiết kế của nền tảng, Tiến sĩ Lindsey Brigman, khăng khăng muốn đi cùng với đội SEAL, mặc dù người chồng bị ghẻ lạnh của cô là Virgil "Bud" Brigman là quản đốc hiện tại.

Trong quá trình điều tra ban đầu về Montana, việc cắt điện trong tàu chìm của đội dẫn đến Lindsey nhìn thấy một ánh sáng kỳ lạ bao quanh phụ, mà sau này cô gọi là "trí thông minh phi hành tinh" hay "NTI". Trung úy Hiram Coffey, trưởng nhóm SEAL, được lệnh tăng tốc nhiệm vụ và lấy một trong những tàu ngầm nhỏ mà không có sự cho phép của Deep Core để lấy lại đầu đạn tên lửa Trident từ Montana khi cơn bão ập đến, khiến phi hành đoàn không thể ngắt kết nối từ tàu hỗ trợ bề mặt của họ trong thời gian. Cần cẩu cáp bị xé khỏi tàu và rơi xuống rãnh, kéo Deep Core xuống cạnh trước khi nó dừng lại. Giàn khoan bị ngập một phần, làm chết một số thành viên phi hành đoàn và làm hỏng hệ thống điện của nó.

Phi hành đoàn chờ đợi cơn bão để họ có thể khôi phục liên lạc và được giải cứu. Khi họ đấu tranh chống lại cái lạnh, họ thấy các NTI đã hình thành một cột nước hoạt hình đang khám phá giàn khoan. Mặc dù họ tò mò đối xử với nó, Coffey vẫn kích động và cắt nó làm đôi bằng cách đóng một vách ngăn áp lực lên nó, khiến nó rút lui. Nhận ra rằng Coffey đang mắc chứng hoang tưởng do hội chứng thần kinh cao áp, phi hành đoàn đã theo dõi anh ta thông qua một phương tiện hoạt động từ xa, tìm thấy anh ta và một thành viên của đội SEAL khác tham gia chế tạo đầu đạn để tấn công NTI. Để cố gắng ngăn chặn anh ta, Bud đã bơi đến khu vực phóng đầu đạn để chiến đấu với Coffey nhưng Coffey đã trốn thoát trong một con tàu ngầm nhỏ với đầu đạn đã được chuẩn bị sẵn; Bud và Lindsey đuổi theo con tàu khác và làm hỏng cả hai. Coffey có thể phóng đầu đạn vào rãnh, nhưng phần tàu của anh ta trôi qua rìa, nghiền nát anh ta khi nó nổ tung. Con tàu của Bud không thể hoạt động và chỉ với một bộ đồ lặn chức năng, Lindsey quyết định đi vào hạ thân nhiệt sâu khi nước lạnh của đại dương. Bud bơi trở lại nền tảng với cơ thể của mình; Ở đó, anh và phi hành đoàn điều hành CPR.Một thành viên khác của đội SEAL, Oblign Monk, giúp Bud sử dụng bộ đồ lặn thử nghiệm được trang bị thiết bị thở chất lỏng để sống sót đến độ sâu đó, mặc dù anh ta sẽ chỉ có thể giao tiếp qua bàn phím trên bộ đồ. Bud bắt đầu chuyến lặn của mình, được hỗ trợ bởi giọng nói của Lindsey để giữ cho anh ta mạch lạc chống lại tác động của áp lực gắn kết, và chạm tới đầu đạn. Với lượng oxy còn lại trong hệ thống, Bud giải thích rằng anh biết đó là chuyến đi một chiều và nói với Lindsey rằng anh yêu cô. Khi anh ta chờ đợi cái chết, một NTI tiếp cận Bud, nắm lấy tay anh ta và hướng dẫn anh ta đến một con tàu ngoài hành tinh nằm sâu trong rãnh. Bên trong con tàu, các NTI tạo ra một túi khí quyển cho Bud, cho phép anh ta thở bình thường. Các NTI sau đó phát lại tin nhắn của Bud cho vợ và họ nhìn nhau với sự hiểu biết.

Trên Deep Core, phi hành đoàn đang chờ giải cứu khi họ thấy một thông báo từ Bud rằng anh đã gặp một số người bạn và cảnh báo họ hãy giữ lấy. Căn cứ rung chuyển và ánh sáng từ rãnh mang đến sự xuất hiện của con tàu ngoài hành tinh. Nó nổi lên mặt nước đại dương, với Deep Core và một số tàu mặt nước mắc cạn trên thân tàu. Phi hành đoàn của Deep Core thoát khỏi nền tảng, ngạc nhiên khi họ không phải chịu đựng chứng bệnh giải nén. Họ thấy Bud bước ra khỏi con tàu ngoài hành tinh và Lindsey vui không kể xiết ôm chầm lấy anh.

• Phiên bản đặc biệt

Trong phiên bản mở rộng, các sự kiện trong phim được chơi trong bối cảnh xung đột giữa Hoa Kỳ và Liên Xô, với tiềm năng cho chiến tranh toàn diện; sự chìm đắm của Montana cũng thúc đẩy sự xâm lược. Có nhiều xung đột giữa Bud và Lindsey liên quan đến mối quan hệ trước đây của họ. Sự bổ sung chính là kết thúc: khi Bud được đưa lên con tàu ngoài hành tinh, họ bắt đầu bằng cách cho anh ta xem những hình ảnh về chiến tranh và sự xâm lược từ các nguồn tin tức trên toàn cầu. Người ngoài hành tinh sau đó tạo ra megatsunamis khổng lồ đe dọa bờ biển thế giới, nhưng ngăn chặn chúng ngắn trước khi chúng tấn công. Bud hỏi tại sao họ bỏ qua con người và họ cho Bud thấy thông điệp của anh ta với Lindsey.